AppA funkcionális dinamikájának vizsgálata fluoreszcencia és ultragyors spektroszkópiai eszközökkel

Abstract

Az optogenetika fejlődésével egyre sürgetőbb a fehérjék fény indukálta folyamatainak pontos megismerése. Az adekvát információk hozzásegíthetnek bennünket bizonyos élettani események fénnyel történő szabályozásához. Ilyen folyamat az AppA fotoaktivációja is, melynek eddigi leírásai ugyan ellentmondásokkal tarkítottottak, azonban ezek tisztázása segítheti más jelenségek megértését is. Munkánk célja feltérképezni az AppA 104-es triptofánjának fotoaktiváció során tanúsított viselkedését, valamint feloldani a szakirodalomban található látszólagos ellentmondásokat. A munka további célja a W104 pozíciójának vizsgálata a FAD-dal történő kölcsönhatásának fényében. Ezeket a folyamatokat igyekeztünk minél több módszerrel megvizsgálni, hogy elegendő bizonyítékot szerezzünk a W104 dinamikájának hiteles leírásához, ezért fluoreszcencia élettartam-lecsengés, anizotrópia-lecsengés, kioltási, tranziens infravörös és FRET méréseket végeztünk. A mérések során elengedhetetlen biztosítani, hogy a kinyert adatok valóban a W104- re vonatkozzanak, ennek érdekében törekedtünk a potenciálisan zavaró tényezőket a lehető legteljesebb mértékben kizárni.